国际龟鳖生存联盟通过环境 DNA 确认全球第四只斑鳖。什么是环境 DNA?为什么要通过它来确认斑鳖?

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  • 什么是环境DNA?

eDNA的原始定义其实很简单,是指在环境样品中所有被发现的不同生物的基因组DNA的混合

野外eDNA提取代替传统的生物多样性调查(图片来源:https://www.google.com.hk/)

这里的环境样品是一个非常宽松的概念,可以包括土壤、沉积物、排泄物、空气、水体,甚至生物个体本身(如马氏网捕获的昆虫)。动物在某个环境中生活,身上的各种痕迹会携带者自身DNA掉落到四周。作为一项技术,分析eDNA的目的就是获取这些环境样品中DNA所属物种的分类学信息和基因功能信息。再讲通俗一点,科学家提取环境样品中的eDNA,就是为了分析这些DNA分别是属于哪些物种,从而证实在相应环境中存在哪些物种。eDNA的目的,与传统的动植物分类调查其实是一致的。

  • 为什么要通过它来确认班鳖的存在?

在寻找班鳖的过程中,在云南红河马堵山水库和越南河内西部的春庆湖,陆续有些疑似斑鳖的线索,但没有确切的证据,专家们还不敢确认。就可以通过eDNA,来做进一步的确认。

说得更直白点,先是科研人员拍到了疑似班鳖的身影,但只是“疑似”,不够确切,接下来为了确认,就提取环境样品中的各种DNA,进行分析,发现这里面确实有班鳖的DNA,确认了它的存在。

所以未来,科研人员也非常希望通过这一技术能确认红河流域班鳖的存在,让它们加入斑鳖的保育计划,尽快地繁殖出后代。

  • 最后,同意 @不正不经 说的,eDNA没那么神奇,也没那么万能。

eDNA面临的最大挑战就是环境样品的复杂性,不仅包含各种生物的DNA分子,还包括一些已降解或被破坏的胞外DNA,以及各式各样奇怪的物质,因此并没有一种标准化的方法可以进行统一的样本处理。

实验能否成功很大程度上取决于样品本身,换一个委婉的说法,就是运气。

之前发了一篇文章,想看更详细介绍的,可以移步这里 eDNA技术确认全球第四只斑鳖的存在!未来,在云南能发现第五只吗?

作者:从水到陆工作室

说这个是“生物黑科技”就夸张了。。。

环境DNA(environmental DNA,eDNA)就是某个物种在生活环境中留下的DNA,来源包括表皮细胞、排泄物等,之所以用eDNA而非样本DNA,就是因为样本数量太少导致无法捕捉。检测eDNA能给光学观测提供遗传信息证据支持。这就好比犯罪现场监视器只拍到了嫌疑人的模糊画面,需要现场提取的DNA来确认嫌疑人身份。在此次确认斑鳖的考察活动中,也是先拍到了疑似斑鳖的照片,再做eDNA检测来双重确定的。

但eDNA的可靠性并不高,尤其对于稀有物种的确认来说,需要先确认大概活动范围,才有可能采集到水体中的微量eDNA。此外,因为PCR本身的技术问题,当环境中存在影响因子,或eDNA浓度过低时,假阳性/假阴性的发生概率都会非常高。所以,eDNA的结果,只能作为稀有物种是否存在的辅助证据,光学观测还是证据力度最高的。